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1.辣椒素具有很強的鎮痛和消炎作用。應用主要用于單方或復方軟膏劑等制劑的生產，廣泛用于治療關節炎、肌肉疼痛、背痛、運動扭傷和帶狀皰疹后遺留神經痛等疾病。
2.以辣椒素作為阻止海洋生物附著的活性成分制造的無毒生物防污漆，大量用于海洋船舶，以防止海洋生物的Chemicalbook附著，保障輪船在海洋中的正常航行，同時可大量用于沿海地區的熱電站、核電站等需要用大量海水進行熱交換的設備，以防止海洋生物堵塞進水管。
3.辣椒素作為害蟲驅避劑，已用作制造防白蟻、防老鼠的功能塑料粒料和涂料，以供電纜、地下建筑物和民用家具制造業使用。
4.利用人工合成辣椒堿的強烈的催淚催嚏作用，用于制造催淚等驅逐器械、個人防衛用品。
5.在食品中的應用：飲品中辣味和辣感應用以及在肉制品中的應用。水溶性辣椒素，放在飲品當中，無色透明，既不會影響產品本來的顏色，而且口感還是非常柔和的辣感，這樣不會和咖啡或者飲品起到沖突，主味不會影響，后辣會讓您有一種意外的驚喜。所以現在的飲品也在和咸味來搭配，會碰撞出不一樣的效果和概念。
辣椒素功能：將水溶性顆粒辣椒素應用于肉制品。在腌制的過程中，辣椒素迅速溶于腌料并滲透到肉制品中，不僅起到了去腥作用，同時也提升肉的鮮美口感。裹粉后油炸，色澤金黃不反黑。入口的感覺鮮香酥脆，辣感柔和均勻。
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